Из документации (Описание приложений -> Приложение сервер):
Приложение Сервер предназначено для управления базой архивных данных системы, ведения резервной копии данных, математических расчётов в соответствии с заданной конфигурацией и предоставления информации по запросам клиентов.
Сервер является службой, которая не имеет пользовательского интерфейса и работает постоянно в фоновом режиме вне зависимости от входа и выхода пользователей в операционную систему. Графическая оболочка для настройки Сервера встроена в приложение Администратор.