Добрый день!
Rapid SCADA 6 использует редактор от 5-й версии, поэтому по идее патч должен работать. Я лично не пробовал.
Нужны подробности ошибок. Разработчики патча на англоязычном форуме, можно у них спросить.
Перезапустил файл deploy-windows.exe с закрытым администратором. Запускаю ScadaSchemeEditor.exe от имени администратора. (можно в свойствах файла в совместимости установить галочку всегда запускать от администратора). Полагаю это из-за прав на запись в файлы .xml