1) Возможно ли создание своих таблиц, внутри справочников?
Как вариант — загрузить данные из Вашего файла CSV или XML в свою структуру данных, используя механизм формул. Но пожалуй, удобнее такие относительно сложные действия выполнять, написав свой модуль, который подключается к Серверу.
2) Возможно ли получение значения из таблицы по индексу формулой? (переформулирую получение данных из таблицы по запросу, например по индексу получить значение столбца «Значение» или по значению столбца А получить другой столбец В)
Вы можете в формулах создать объекты типа Dictionay и получать значения по ключу. Почитайте подробнее в документации C#.
3) Возможно ли получение формулой значения поля «Значения команды» в каналах управления.
Да, формула должна преобразовывать индекс нажатой кнопки в отправляемое значение.