А, извиняюсь, Telegram это драйвер, регистрационный файл должен быть в папке конфигурации Коммуникатора и находиться в ПРОЕКТЕ. Иначе если вы передаете Конфигурацию серверу и там файла нет, то он будет стерт.
Просто немного концепцию поймите, что при каждой передаче вы замещаете файлы из папки конфигурации проекта в рабочую систему.