Попробуйте настроить Линию не через виртуальный порт, а как TCP клиент и снять галочку «оставаться на связи». Тогда каждая сессия будет снова производить подключение.
Нет скринов. При работе в Scada поверх TCP не надо менять RTU на TCP параметр TransMode, он так и остается RTU. Настраивается IP и порт, который указывается в настройках преобразователя так же, как при создании виртуального COM порта.